Odjel za zaštitu i digitalizaciju knjižnične građe osnovan je 2008. godine. Odjel je specijaliziran za zahvate konzervacije i restauracije knjiga, novina, plakata i umjetnina na papiru. Djelovanje Odjela obuhvaća i preventivne zahvate u vidu kontrole stanja i uvjeta čuvanja pohranjene knjižnične građe.

U suradnji s ostalim odjelima Knjižnice pokrenuti su zahvati digitalizacije građe knjižnice kako bi se knjižnična građa još bolje zaštitila i učinila što dostupnijom korisnicima.

Odjel je opremljen sofisticiranom opremom koju koriste stručni djelatnici radi kvalitetnog izvođenja složenih zahvata konzervacije, restauracije i digitalizacije tiskane knjižnične bašinske građe.